雲住寺為大韓佛教曹溪宗第21教區松廣寺轄下的分寺，相傳是新羅末期道詵國師依據風水地理所建的裨補寺院。所謂裨補寺院，意指「協助保護」，過強之處則助其弱化，過虛之處則助其凝實。順著自然的韻律而行，達到護國與謀取眾生利益之目的，是承載了道詵國師智慧的寺院。1984~89年，於發掘調查過程中，出土了金銅佛立像、純青瓷、鑲嵌青瓷、粉青瓷器的破片、瓦片等文物。由此可推估，這裡最晚應建於11世紀初的高麗初期。據《東國輿地志》所載，高麗時代惠明僧人與1,000多名僧人一同打造了千佛千塔。此惠明僧人應與高麗光宗21年(970年)建灌燭寺大佛的慧明僧人為同一人，而這也成為支持雲住寺建於高麗初期一說的有力證據。



1984年，發現了刻有「弘治八年」的瓦片，並留有燕山君1年(1495年)進行第4次重修的紀錄，由此可知雲住寺至朝鮮時代初期仍存在的事實。但之後丁酉再亂(1597~1598)時，被倭寇侵襲而廢寺。約於1800年，由雪潭自優僧人重建了倒下的佛像、佛塔，以及藥師殿等建築，才使雲住寺呈現今日的樣貌。在寺院周邊有91座石佛(完整留存 50座)與21座石塔。雲住寺的代表文物為石造佛龕(寶物第797號)、9層石塔(寶物第796號)、圓型多層石塔(寶物第798號)、臥佛等。